| | Vietscholar forum | | 
01-25-2010
|  | Member | | Tham gia ngày: Dec 2009 Đến từ: vườn chuối
Bài gởi: 39
Thanks: 33 Thanked 9 Times in 9 Posts Downloads: 1 Uploads: 0 | | Từ Computer Science nhảy sang Bioinformatics Chào các bác,
Em đang tìm hiểu Bioinformatics nhưng tìm hoài toàn gặp người học Biology chuyển sang hướng này. Em là dân CS thuần tuý nếu nhảy sang hướng này thì có khả thi không các bác?
Em cũng tìm hiểu sơ qua về course của 1 số trường thấy có vẻ không khó lắm (cái này chủ quan của em thôi, dựa theo tên course em search trên gô gơ coi nó dạy gì ), coi cả điều kiện admission cũng không thấy đề cập cái undergraduate phải là Biology.
Các bác ở đây cho em xin một ít thông tin với ạ. | 
01-25-2010
|  | Thành viên dự bị | | Tham gia ngày: Jan 2010
Bài gởi: 2
Thanks: 0 Thanked 1 Time in 1 Post Downloads: 0 Uploads: 0 | | Mình học Biochemistry hệ kĩ sư 5 năm, vừa rồi có gửi bảng điểm cho ông giáo ở Mẽo xem, mà ông ý bảo số trình học của mình chưa đủ điều kiênj để apply(bảng điểm rất đẹp 9,2), hơn nữa có một số môn ở Mẽo có mà VN ko có. Nên mình nghĩ bạn nêm xem xét lại khi quyết định rẽ ngang như vậy!! | 
01-25-2010
|  | Trusted member | | Tham gia ngày: Jun 2009
Bài gởi: 81
Thanks: 5 Thanked 14 Times in 12 Posts Downloads: 0 Uploads: 0 | | | Trích: | |  | | | Chào các bác,
Em đang tìm hiểu Bioinformatics nhưng tìm hoài toàn gặp người học Biology chuyển sang hướng này. Em là dân CS thuần tuý nếu nhảy sang hướng này thì có khả thi không các bác?
Em cũng tìm hiểu sơ qua về course của 1 số trường thấy có vẻ không khó lắm (cái này chủ quan của em thôi, dựa theo tên course em search trên gô gơ coi nó dạy gì ), coi cả điều kiện admission cũng không thấy đề cập cái undergraduate phải là Biology.
Các bác ở đây cho em xin một ít thông tin với ạ. | | | | | Chuyện bạn học CS đổi qua bioinfo là hoàn toàn bình thường. Theo mình nghĩ có khi còn dễ hơn từ biology chuyển qua. Hình như rất nhiều khoa CS có hướng nghiên cứu bioinfo. | | I thank bearkiller for this original paper: | | 
01-25-2010
|  | Chuyên gia ban nick | | Tham gia ngày: Apr 2009
Bài gởi: 1,210
Thanks: 340 Thanked 319 Times in 207 Posts Downloads: 0 Uploads: 0 | | Đúng đấy, trên này có cậu Pisces cũng là dân CS thuần tuý, giờ làm về Bioinformatics đấy thôi. Nếu nói Bioinformatics là một nhánh của CS thì cũng chẳng có gì sai cả. | | I thank SpringerCV for this original paper: | | 
01-25-2010
|  | Senior Member | | Tham gia ngày: Jan 2010
Bài gởi: 346
Thanks: 37 Thanked 154 Times in 91 Posts Downloads: 0 Uploads: 0 | | Từ Computer Science nhảy sang Bioinformatics
Chào các bác,
Em đang tìm hiểu Bioinformatics nhưng tìm hoài toàn gặp người học Biology chuyển sang hướng này. Em là dân CS thuần tuý nếu nhảy sang hướng này thì có khả thi không các bác?
Em cũng tìm hiểu sơ qua về course của 1 số trường thấy có vẻ không khó lắm (cái này chủ quan của em thôi, dựa theo tên course em search trên gô gơ coi nó dạy gì ), coi cả điều kiện admission cũng không thấy đề cập cái undergraduate phải là Biology.
Các bác ở đây cho em xin một ít thông tin với ạ.
Các bạn ở đây không biết đến 2 con chim đầu đàn của Tin sinh VN: anh em nhà Lê Sĩ Quang và Lê Sĩ Vinh (đều là IIO vàng và bạc). Các bạn này đều là dân Tin chuyển sang.
Bạn hơi ngộ nhận về Bioinformatics một tí. Dân Sinh sang làm Bioinformatics thường là dạng: thí nghiệm + dùng bioinformatics để hỗ trợ (database mới, modeling phân tử...v.v). Còn vẫn phải có dân Tin để cải tiến programs, thuật toán các thứ. Dân từ Sinh chuyển sang không làm nổi cái này. | | I thank Mê Nấm for this original paper: | | 
01-26-2010
|  | Lai vô ảnh, khứ vô hình | | Tham gia ngày: Jun 2009
Bài gởi: 231
Thanks: 7 Thanked 51 Times in 35 Posts Downloads: 0 Uploads: 0 | | Bạn vnos đang học under ở VN hay nước khác?
Tiếp cận bioinformatics từ hướng CS thì hơi khác với từ hướng biology. Ko nhất thiết phải hiểu sâu về biology mới làm dc bioinformatics (tất nhiên càng biết nhiều về biology thì càng có lợi hơn). Có những vấn đề trong đó chỉ cần hiểu các kiến thức cơ bản về biology là dc (genomics, cell and molecular biology...). Background về CS hoàn toàn có thể chuyển sang dc. Dĩ nhiên là phải học thêm vài courses về biology. Nhìn qua các courses đó có vẻ ko khó, nhưng học thì thấy cũng ko dễ lắm. Bên cạnh kiến thức thì tiếng Anh cũng là 1 vấn đề.
Phải biết về Stats nữa, ở mức kiến thức cơ bản cũng dc, nhưng nếu có kiến thức sâu về Stats thì càng tốt, sẽ có nhiều thứ hay ho để làm. Ngoài ra cần kiến thức về maths (càng giỏi càng tốt), algorithms (và một số kiến thức liên quan), và dĩ nhiên, programming (and programming languages).
Hiện tại rất nhiều trường có chương trình bioinformatics, hoặc là 1 phần của CS, hoặc là tách ra độc lập. Bạn có thể tìm trên mạng.
Chuyện ngoài lề: quỹ nghiên cứu cho bioinformatics thường là từ NIH, nên nhiều kinh khủng. Ví dụ trong 1 năm NSF cấp khoảng 5-6 tỉ đô cho toàn bộ các ngành nghiên cứu, trong khi NIH cấp đến 28-30 tỉ đô chỉ cho các nghiên cứu liên quan.
thay đổi nội dung bởi: Pisces, 01-26-2010 lúc 03:08 PM | | I thank Pisces for this original paper: | | 
01-27-2010
|  | Member | | Tham gia ngày: Sep 2009 Đến từ: Dept of CS,HUT
Bài gởi: 33
Thanks: 13 Thanked 1 Time in 1 Post Downloads: 0 Uploads: 0 | | Tin sinh học là 1 ngành của CS,chắc là thế,vì xem mấy khoa CS các trường đều thấy research areas như vậy cả:-?
bioinfor có lẽ 1 trong những ngành phát triển nhất trong CS,năm 2009 tạp chí Times cũng bình chọn cho công trình giải mã bộ gen của người bị mù màu là thành tựu đứng thứ 2 của năm.
theo các anh (chị) thì bioinfor khác với computational biology như thế nào a :-? hay là 1 phần con của nó.
thay đổi nội dung bởi: ttmhut, 01-27-2010 lúc 01:07 AM | 
01-27-2010
|  | TM tay to | | Tham gia ngày: Jun 2009 Đến từ: Stony Brook
Bài gởi: 1,675
Thanks: 118 Thanked 458 Times in 287 Posts Downloads: 1 Uploads: 1 | | Chả biết giải thích thế nào, đọc wiki cho nó nhanh.
Nhưng nói gọn là bioinfomatics liên quan tới CS nhiều hơn, còn computational bio thì liên quan tới biochem nhiều hơn. Cái chung là dùng máy tính .
wiki | Trích: |  | | | Computational biology is an interdisciplinary field that applies the techniques of computer science, applied mathematics and statistics to address biological problems. The main focus lies on developing mathematical modeling and computational simulation techniques. By these means it addresses scientific research topics with their theoretical and experimental questions without a laboratory. It encompasses the fields of:
Computational biomodeling, a field concerned with building computer models of biological systems.
Bioinformatics, which applies algorithms and statistical techniques to the interpretation, classification and understanding of biological datasets. These typically consist of large numbers of DNA, RNA, or protein sequences. Sequence alignment is used to assemble the datasets for analysis. Comparisons of homologous sequences, gene finding, and prediction of gene expression are the most common techniques used on assembled datasets; however, analysis of such datasets have many applications throughout all fields of biology.
Mathematical biology aims at the mathematical representation, treatment and modeling of biological processes, using a variety of applied mathematical techniques and tools.
Computational genomics, a field within genomics which studies the genomes of cells and organisms. High-throughput genome sequencing produces lots of data, which requires extensive post-processing (genome assembly) and uses DNA microarray technologies to perform statistical analyses on the genes expressed in individual cell types. This can help find genes of interest for certain diseases or conditions. This field also studies the mathematical foundations of sequencing.
Molecular modeling, which consists of modelling the behaviour of molecules of biological importance.
Protein structure prediction and structural genomics, which attempt to systematically produce accurate structural models for three-dimensional protein structures that have not been determined experimentally.
Computational biochemistry and biophysics, which make extensive use of structural modeling and simulation methods such as molecular dynamics and Monte Carlo method-inspired Boltzmann sampling methods in an attempt to elucidate the kinetics and thermodynamics of protein functions.
| | | | |
__________________ Không có gì quí hơn độc lập tự do. Tốt nhất là không lấy vợ.
thay đổi nội dung bởi: haichit., 01-27-2010 lúc 12:59 AM | 
01-27-2010
|  | Member | | Tham gia ngày: Dec 2009 Đến từ: vườn chuối
Bài gởi: 39
Thanks: 33 Thanked 9 Times in 9 Posts Downloads: 1 Uploads: 0 | | | Trích: | |  | | | Bạn vnos đang học under ở VN hay nước khác?
Tiếp cận bioinformatics từ hướng CS thì hơi khác với từ hướng biology. Ko nhất thiết phải hiểu sâu về biology mới làm dc bioinformatics (tất nhiên càng biết nhiều về biology thì càng có lợi hơn). Có những vấn đề trong đó chỉ cần hiểu các kiến thức cơ bản về biology là dc (genomics, cell and molecular biology...). Background về CS hoàn toàn có thể chuyển sang dc. Dĩ nhiên là phải học thêm vài courses về biology. Nhìn qua các courses đó có vẻ ko khó, nhưng học thì thấy cũng ko dễ lắm. Bên cạnh kiến thức thì tiếng Anh cũng là 1 vấn đề.
Phải biết về Stats nữa, ở mức kiến thức cơ bản cũng dc, nhưng nếu có kiến thức sâu về Stats thì càng tốt, sẽ có nhiều thứ hay ho để làm. Ngoài ra cần kiến thức về maths (càng giỏi càng tốt), algorithms (và một số kiến thức liên quan), và dĩ nhiên, programming (and programming languages).
Hiện tại rất nhiều trường có chương trình bioinformatics, hoặc là 1 phần của CS, hoặc là tách ra độc lập. Bạn có thể tìm trên mạng.
Chuyện ngoài lề: quỹ nghiên cứu cho bioinformatics thường là từ NIH, nên nhiều kinh khủng. Ví dụ trong 1 năm NSF cấp khoảng 5-6 tỉ đô cho toàn bộ các ngành nghiên cứu, trong khi NIH cấp đến 28-30 tỉ đô chỉ cho các nghiên cứu liên quan.  | | | | | Cám ơn anh, em tốt nghiệp Khoa Học Tự Nhiên ở Sài Gòn.
Về tiếng anh chuyên ngành em không lo lắm, statistics thì hoạc mấy môn nâng cao về nó nên giờ kiến thức..cơ bản chắc là vẫn còn.
Em tính apply ngành này bên EU thay vì Mĩ chưa có GRE, em mới có IELTS thôi. | 
01-27-2010
|  | Lai vô ảnh, khứ vô hình | | Tham gia ngày: Jun 2009
Bài gởi: 231
Thanks: 7 Thanked 51 Times in 35 Posts Downloads: 0 Uploads: 0 | | | Trích: | |  | | | Tin sinh học là 1 ngành của CS,chắc là thế,vì xem mấy khoa CS các trường đều thấy research areas như vậy cả:-?
bioinfor có lẽ 1 trong những ngành phát triển nhất trong CS,năm 2009 tạp chí Times cũng bình chọn cho công trình giải mã bộ gen của người bị mù màu là thành tựu đứng thứ 2 của năm.
theo các anh (chị) thì bioinfor khác với computational biology như thế nào a :-? hay là 1 phần con của nó. | | | | | Nói bionformatics là 1 ngành của CS cũng ko chuẩn, nó là liên ngành (interdisciplinary field). Hiện tại các thuật ngữ đang nở rộ, nhiều khi đọc hoa cả mắt. 
Theo mình hiểu, computational biology là 1 thuật ngữ chung, trong đó người ta nhìn các vấn đề sinh học theo khía cạnh tính toán. Sinh học bây giờ đang đi sâu vào tìm hiểu cơ chế của sự sống ở mức tế bào, phân tử. Người ta thấy rằng việc áp dụng các kỹ thuật tính toán tỏ ra khá hiệu quả trong việc tìm hiểu các cơ chế này. Bioinformatics có thể coi là 1 lĩnh vực hẹp của computational biology, trong đó người ta chủ yếu quan tâm đến việc xử lý các nguồn dữ liệu sinh học (datasets), phân tích các datasets này dựa vào các công cụ maths, stats, computer sciences...
Cái công trình mà bạn nói theo mình hiểu nó là kết quả nghiên cứu của biology. Các nguồn dữ liệu như vậy là input của bioinformatics (và có thể của computational biology nói chung?). Mình ko biết gì nhiều về sinh học, nên cũng ko dám bàn nhiều, nhưng đại khái, hiện nay việc đọc được thông tin về gene nói riêng và DNA nói chung (cũng như các thành phần cấu tạo của tế bào...) về cơ bản là khả thi. Ví dụ, người ta đã giải mã dc toàn bộ gene người. Nhưng chỉ có dữ liệu không thôi thì chưa đủ. Nói cách khác, đọc dc mà ko hiểu dc. Kiểu như 1 người cố gắng học dc chữ để đọc dc 1 chương trình máy tính ấy, sau khi học chữ xong rồi thì đọc dc, nhưng đọc dc mà ko hiểu cơ chế của nó ra sao, mục đích là gì, tại sao lại như vậy... Như vậy lại phải học thêm CS để hiểu về cơ chế của chương trình đó. Ví dụ, đọc dc gene là 1 chuỗi ATCGTAGC..., câu hỏi là tại sao lại là chuỗi đó mà ko phải là chuỗi khác? Những câu hỏi như vậy đặt ra những vấn đề nghiên cứu cực kỳ thú vị cho ngành này. | Trích: | |  | | | Cám ơn anh, em tốt nghiệp Khoa Học Tự Nhiên ở Sài Gòn.
Về tiếng anh chuyên ngành em không lo lắm, statistics thì hoạc mấy môn nâng cao về nó nên giờ kiến thức..cơ bản chắc là vẫn còn.
Em tính apply ngành này bên EU thay vì Mĩ chưa có GRE, em mới có IELTS thôi. | | | | | Ở EU thì mình ko rõ. Mình chỉ biết 1 số chương trình ở Mỹ thôi. EU cũng có nhiều trung tâm rất tốt về ngành này.
Thấy bọn Ấn Độ nó có hẳn chương trình ĐH về bioinformatics.
thay đổi nội dung bởi: Pisces, 01-27-2010 lúc 01:19 PM |  | | Latex Maths & Physics Editor ...
| | | |
Ðang đọc: 1 (0 thành viên và 1 khách) | | | | Ðiều Chỉnh | Kiếm Trong Bài | | | |
Posting Rules
| You may not post new threads You may not post replies You may not post attachments You may not edit your posts HTML đang Tắt | | | | |