Bạn nào thích articles nào trong computational biology thì post lên đây share với mọi người cho zui. Nên post title, tên tác giả, abstract và link đến article. Nếu có thể thì viêt thêm nhận xét tại sao nó thú vị, nếu ngại thì không cần đưa ý kiến cũng được. Vì ai cũng chỉ làm chuyên sâu vê ngành của mình nên ít khi chú ý tới hướng nghiên cứu khác nên hi vọng topic này giúp những ai cùng hội cùng thuyền có thể tự sướng, chia sẻ những gì mà mình thích, đồng thời mang thêm thông tin đến cho mọi người để cùng nhau xóa mù chữ. Nó không hót như các topic về gái xinh, hôn nhân và gia đình nhưng ít ra nó cũng có ích.
__________________ Không có gì quí hơn độc lập tự do. Tốt nhất là không lấy vợ.
Structural and Energetic Analysis on the Complexes of Clinically Isolated Subtype C HIV-1 Proteases and Approved Inhibitors by Molecular Dynamics Simulation
Shou Matsuyama, Ay Aydan, Hirotaka Ode, Masayuki Hata, Wataru Sugiura, Tyuji Hoshino
The Journal of Physical Chemistry B 2010 114 (1), 521-530
[Only registered and activated users can see links. ]
Trích:
HIV-1 has a large genetic diversity. Subtype B HIV-1 is commonly found in patients in developed countries. In contrast, an increasing number of patients are infected with the non-B subtype viruses, especially with subtype C HIV-1, in developing countries. It remains to be clarified how mutations or polymorphisms in non-B subtype HIV-1 influence the efficacy of the approved inhibitors. In this study, we have performed molecular dynamics simulations on clinically isolated subtype C HIV-1 proteases in complex with three kinds of approved inhibitors. From the structural and energetic viewpoints, we identified the polymorphisms influencing on the binding of the inhibitors. The effect of the V82I mutation on the association with chemicals and the reason for rare appearance of the D30N mutation in subtype C HIV-1 were discussed in terms of the change of geometry of the residues in HIV-1 protease.
Mấy cái nghiên cứu về HIV-1 này được cho khá nhiều funding, cũng nhờ nó mà giáo của haichit được rất nhiều computer time từ các trung tâm siêu máy tính.
__________________ Không có gì quí hơn độc lập tự do. Tốt nhất là không lấy vợ.
Interesting articles for computational bio 
